酶标仪实际上就是一台变相的专用光电比色计或分光光度计，其基本工作原理与主要结构和光电比色计基本相同. 图示是一种单通道自动进样的酶标仪工作原理图.光源灯发出的光波经过滤光片或单色器变成一束单色光，进入塑料微孔极中的待测标本.该单色光一部分被标本吸收，另一部分则透过标本照射到光电检测器上，光电检测器将这一待测标本不同而强弱不同的光信号转换成相应的电信号.电信号经前置放大，对数放大，模数转换等信号处理后送入微处理器进行数据处理和计算，最后由显示器和打印机显示结果. 微处理机还通过控制电路控制机械驱动机构X方向和Y方向的运动来移动微孔板，从而实现自动进样检测过程.而另一些酶标仪则是采用手工移动微孔板进行检测，因此省去了X,Y方向的机械驱动机构和控制电路，从而使仪器更小巧，结构也更简单.
    微孔板是一种经事先包理专用于放置待测样本的透明塑料板，板上有多排大小均匀一致的小孔，孔内都包埋着相应的抗原或抗体，微孔板上每个小孔可盛放零点几毫升的溶液.
    光是电磁波，波长100nm～400nm称为紫外光，400nm～780nm之间的光可被人眼观察到，大于780nm称为红外光。人们只所以能够看到色彩，是因为光照射到物体上被物体反射回
   
    各种品牌的酶标仪在使用时，应遵循的通用原则是：
    1、当地电压不稳时，请使用稳压电源。
    2、仪器运行过程中，如遇不正常停电，请及时关掉仪器电源，直至重新来电。
    3、请将仪器放置于干燥环境中，仪器三侧应离开墙面10cm以上。
    4、使用过程中，请勿打开后盖。
    5、更换滤光片时，注意不要将手与滤光片镜面接触。
    6、更换灯泡时，请等仪器完全冷却后进行。
    7、不使用仪器时，请及时盖好防尘罩。
    8、为延长仪器的使用寿命，使用完仪器后，请及时关闭电源